Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCAPHQ15003 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCAPHQ15003 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms