Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL19A1Q14993 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms