Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NFIXQ14938 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms