Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GTF2H3Q13889 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms