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| RUNX3 | Q13761 | LARP7P3-201 | ENST00000579888 | 337 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NF1P5-201 | ENST00000588287 | 448 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008764.2-201 | ENST00000597226 | 376 nt | TSL 5 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008687.2-201 | ENST00000597865 | 520 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022145.1-201 | ENST00000600673 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024257.5-201 | ENST00000612739 | 531 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157817.1-201 | ENST00000614264 | 790 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC243756.2-201 | ENST00000618406 | 463 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL713922.2-201 | ENST00000619384 | 716 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC25A46-208 | ENST00000513807 | 1546 nt | TSL 2 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LPP-220 | ENST00000617246 | 18220 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MBNL1-220 | ENST00000493459 | 4205 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GALNT1-201 | ENST00000269195 | 3847 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NR3C1-212 | ENST00000504572 | 3389 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GPR34-202 | ENST00000378142 | 1928 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX30-201 | ENST00000376019 | 1689 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF807-201 | ENST00000328088 | 1707 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF876P-202 | ENST00000398732 | 1485 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UGT2A2-201 | ENST00000604021 | 1544 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MT-ND2-201 | ENST00000361453 | 1042 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-92P-201 | ENST00000363783 | 136 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | snoZ40.1-201 | ENST00000364540 | 72 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPANXN4-201 | ENST00000370504 | 560 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERHP2-201 | ENST00000402323 | 299 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC084290.1-201 | ENST00000434995 | 374 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022537.1-201 | ENST00000435271 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01688-201 | ENST00000435492 | 259 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024908.1-202 | ENST00000441907 | 764 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTENP1-201 | ENST00000447117 | 1215 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HRAT17-201 | ENST00000447785 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360091.1-201 | ENST00000447949 | 496 nt | TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX6CP18-201 | ENST00000448769 | 222 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB3P21-201 | ENST00000452483 | 547 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010890.1-201 | ENST00000454699 | 469 nt | TSL 4 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL863P-201 | ENST00000462370 | 296 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC39-AS1-201 | ENST00000495357 | 283 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPGN-204 | ENST00000502358 | 312 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPGN-206 | ENST00000503098 | 339 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPGN-207 | ENST00000505212 | 285 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTGES3P3-201 | ENST00000511479 | 482 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPGN-209 | ENST00000514968 | 312 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090136.1-201 | ENST00000520009 | 240 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025524.2-207 | ENST00000520097 | 506 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGS4-207 | ENST00000527809 | 817 nt | TSL 4 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC055720.2-201 | ENST00000537724 | 172 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | APAF1-207 | ENST00000547743 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012404.1-201 | ENST00000560876 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092120.1-201 | ENST00000562211 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007598.2-201 | ENST00000569490 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099489.2-201 | ENST00000574976 | 260 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01470-205 | ENST00000584829 | 681 nt | TSL 3 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SATB1-AS1-207 | ENST00000593741 | 955 nt | TSL 5 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VN1R78P-201 | ENST00000597393 | 564 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069304.3-201 | ENST00000603938 | 1084 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLSCR2-206 | ENST00000610787 | 1001 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021755.4-201 | ENST00000616620 | 456 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157770.1-201 | ENST00000623049 | 439 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090897.3-201 | ENST00000636973 | 1157 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DCAF13P3-201 | ENST00000561147 | 1334 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDE1A-205 | ENST00000435564 | 4885 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CR381670.1-201 | ENST00000624291 | 1693 nt | BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFYVE16-202 | ENST00000505560 | 6599 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020571.1-202 | ENST00000433933 | 1413 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM38B-201 | ENST00000374688 | 3956 nt | TSL 2 BASIC | 3.36 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NCAM2-201 | ENST00000284894 | 4699 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AGTR1-205 | ENST00000461609 | 1545 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC017071.1-201 | ENST00000564407 | 2204 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNIH4-201 | ENST00000366856 | 808 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR217-201 | ENST00000384817 | 110 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAS2R15P-201 | ENST00000390674 | 928 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP56-201 | ENST00000410513 | 331 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRELID3BP11-201 | ENST00000414230 | 479 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BOLA3P4-201 | ENST00000418151 | 400 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COTL1P1-201 | ENST00000422309 | 375 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZDHHC20P2-201 | ENST00000424108 | 429 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CETN4P-201 | ENST00000432407 | 469 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P34-201 | ENST00000433316 | 712 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GTF2IP7-202 | ENST00000436677 | 309 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF7P5-201 | ENST00000441829 | 291 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P48-201 | ENST00000446155 | 598 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC044781.1-201 | ENST00000446193 | 570 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL020994.3-201 | ENST00000449126 | 274 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GRM7-AS3-208 | ENST00000455623 | 947 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133477.1-201 | ENST00000457472 | 514 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02049-201 | ENST00000490647 | 747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC106821.1-201 | ENST00000502861 | 572 nt | TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC084116.2-201 | ENST00000520171 | 415 nt | TSL 4 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PKIA-AS1-203 | ENST00000522807 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIH1D2-206 | ENST00000528775 | 1025 nt | TSL 5 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011611.4-201 | ENST00000547721 | 779 nt | TSL 2 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355097.1-201 | ENST00000555889 | 539 nt | TSL 4 BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AGGF1P8-201 | ENST00000562979 | 1000 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133383.1-201 | ENST00000569292 | 901 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001269.3-201 | ENST00000588718 | 329 nt | BASIC | 3.35 | □□□□□ -1.87 | | |