Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms