Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
ATP1A4Q13733 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms