Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATRQ13535 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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