Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PRPF4BQ13523 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PRPF4BQ13523 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PRPF4BQ13523 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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