Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TUBB3Q13509 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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TUBB3Q13509 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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TUBB3Q13509 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TUBB3Q13509 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TUBB3Q13509 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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