Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMAD4Q13485 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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