Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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SF3B2Q13435 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SF3B2Q13435 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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