Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
XRCC4Q13426 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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