Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATMQ13315 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ATMQ13315 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATMQ13315 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATMQ13315 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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