Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SRSF6Q13247 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SRSF6Q13247 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.4 ms