Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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TRAF1Q13077 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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