Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN3Q13064 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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