Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BNIP3Q12983 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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BNIP3Q12983 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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BNIP3Q12983 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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BNIP3Q12983 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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BNIP3Q12983 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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BNIP3Q12983 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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BNIP3Q12983 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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BNIP3Q12983 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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