Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
EFEMP1Q12805 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EFEMP1Q12805 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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