Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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FOSBP53539 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOSBP53539 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOSBP53539 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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