Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ATP9BO43861 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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