Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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USP18Q9UMW8 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
USP18Q9UMW8 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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