Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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