Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LHX9Q9NQ69 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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LHX9Q9NQ69 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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LHX9Q9NQ69 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LHX9Q9NQ69 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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