Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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