Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP53Q70EK8 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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USP53Q70EK8 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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USP53Q70EK8 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP53Q70EK8 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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