Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
UBR3Q6ZT12 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
UBR3Q6ZT12 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
UBR3Q6ZT12 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
UBR3Q6ZT12 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
UBR3Q6ZT12 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBR3Q6ZT12 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.2 ms