Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDR2Q16832 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms