Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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DDB1Q16531 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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