Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GABRA6Q16445 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms