Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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