Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
E2F4Q16254 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
E2F4Q16254 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms