Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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