Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHRNA6Q15825 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms