Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HMGN3Q15651 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HMGN3Q15651 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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