Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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