Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
R3HDM1Q15032 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms