Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
GPNMBQ14956 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms