Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
CACNA1CQ13936 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CACNA1CQ13936 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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