Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GTF2H2Q13888 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms