Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SPTAN1Q13813 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SPTAN1Q13813 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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