Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TUBA3CQ13748 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms