Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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ATP1A4Q13733 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ATP1A4Q13733 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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