Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATRQ13535 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATRQ13535 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATRQ13535 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
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