Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBB3Q13509 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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