Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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TCIRG1Q13488 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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TCIRG1Q13488 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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TCIRG1Q13488 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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TCIRG1Q13488 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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