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| PTK7 | Q13308 | AL645733.1-201 | ENST00000402250 | 217 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC006150.1-201 | ENST00000412014 | 263 nt | TSL 5 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL591848.1-201 | ENST00000413092 | 322 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | RPL7P46-201 | ENST00000425129 | 740 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| PTK7 | Q13308 | Z82198.2-201 | ENST00000434741 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
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| PTK7 | Q13308 | NOSTRIN-201 | ENST00000317647 | 2294 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AL589740.1-207 | ENST00000607823 | 1962 nt | TSL 5 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | TRAJ58-201 | ENST00000390481 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | POLHP1-201 | ENST00000411806 | 470 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | RNF10P1-201 | ENST00000418589 | 369 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | GPC6-AS1-201 | ENST00000436329 | 698 nt | TSL 5 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AF228730.2-201 | ENST00000438784 | 848 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL162419.1-201 | ENST00000440674 | 873 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | MACROD2-IT1-201 | ENST00000448536 | 665 nt | TSL 5 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ATF7IP-214 | ENST00000540793 | 4142 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | R3HDM1-202 | ENST00000409478 | 4272 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | DSC2-202 | ENST00000280904 | 12325 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | DOCK4-AS1-201 | ENST00000452714 | 2494 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | PDE7A-201 | ENST00000379419 | 2425 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | HEPHL1-201 | ENST00000315765 | 5345 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC239868.2-201 | ENST00000564237 | 4527 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC108751.5-201 | ENST00000492880 | 1336 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | PEX5L-202 | ENST00000392649 | 8540 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | RNA5SP305-201 | ENST00000362665 | 119 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1252P-201 | ENST00000363054 | 104 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | FABP7-202 | ENST00000368444 | 1026 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC007161.1-204 | ENST00000423039 | 460 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | SRSF1P1-201 | ENST00000424058 | 520 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL035404.2-201 | ENST00000424418 | 304 nt | TSL 3 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC005517.2-201 | ENST00000424673 | 553 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |