Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CHRNEQ04844 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms