Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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PGGT1BP53609 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PGGT1BP53609 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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