Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPREP23469 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPREP23469 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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