Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-2B6SEH9 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-2B6SEH9 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-2B6SEH9 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-2B6SEH9 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-2B6SEH9 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms